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NVIDIA与华盛顿大学Baker Lab开放RFD4-Proteina:联合生成蛋白质序列与结构
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作者:
jakeshou
时间:
1 小时前
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NVIDIA与华盛顿大学Baker Lab开放RFD4-Proteina:联合生成蛋白质序列与结构
NVIDIA与华盛顿大学蛋白质设计研究所(Institute for Protein Design)的Baker Lab公布并开放RFD4-Proteina。它采用flow-matching生成方法,可在目标分子环境或结构约束下,同时生成蛋白质序列与全原子三维结构;官方列出的用途包括蛋白生成、结构基序支架、酶设计、小分子结合体与抗体设计、局部扩散及逆折叠等任务。
NVIDIA称,在一项针对200个氨基酸蛋白的基准中,该模型生成设计的速度约为RFdiffusion3的13倍。NVIDIA Hugging Face模型卡显示,当前开放权重约4.36亿参数、FP32文件约1.74GB,采用BSD 3-Clause许可。研究者可从模型卡获取权重与配套代码、文档和数据入口。
这类结果仍属于计算生成与筛选:模型卡明确提醒,计算指标通过不代表设计已具备实验活性;候选蛋白是否能按预期折叠、结合或发挥功能,仍需后续结构评估和实验验证。
NVIDIA官方介绍:https://blogs.nvidia.com/blog/open-models-europe-industry/
开放模型卡:https://huggingface.co/nvidia/RFD4-Proteina
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