学术论文查找工具

搜索PubMed并将论文导入Zotero或生成RIS文件用于EndNote。

环境配置

需要设置环境变量：

• - ZOTEROAPIKEY - Zotero API密钥（获取地址：https://www.zotero.org/settings/keys/new）
• ZOTEROUSERID - 您的Zotero用户ID

快速开始

1. 通过DOI搜索论文

bash
python3 scripts/pubmed_search.py --doi 10.1016/j.cell.2014.07.013

2. 通过标题搜索

bash
python3 scripts/pubmed_search.py --title 循环肿瘤细胞簇

3. 通过作者搜索

bash
python3 scripts/pubmed_search.py --author Aceto N --year 2014

4. 添加到Zotero

bash

通过PMID

通过DOI

5. 批量导入（多个PMID）

bash
python3 scripts/batch_import.py --pmids 25171411,30728496,41212905

6. 生成RIS文件用于EndNote

bash
python3 scripts/generate_ris.py --pmids 25171411,30728496 --output literature.ris

脚本说明

• - pubmedsearch.py - 通过DOI/标题/作者搜索PubMed
• zoteroadd.py - 通过PMID/DOI将论文添加到Zotero
• batchimport.py - 批量添加多篇论文
• generateris.py - 生成RIS文件用于EndNote

使用示例

从引用信息获取PMID

当用户提供如下引用信息时：

Aceto, N.; Bardia, A.; Miyamoto, D. T.; Donaldson, M. C.; Wittner, B. S.; Spencer, J. A.; Yu, M.; Pely, A.; Ting, K.; Haber, D. A.; Maheswaran, S. Circulating Tumor Cell Clusters Are Oligoclonal Precursors of Breast Cancer Metastasis. Cell 2014, 158 (5), 1110–1122. https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.07.013.

1. 1. 提取DOI：10.1016/j.cell.2014.07.013
2. 搜索：python3 scripts/pubmedsearch.py --doi 10.1016/j.cell.2014.07.013
3. 结果：PMID 25171411
4. 添加到Zotero：python3 scripts/zoteroadd.py --pmid 25171411

批量导入到EndNote

用户有多篇论文需要导入到EndNote：

bash

列出所有PMID

然后将RIS文件导入到EndNote：文件 → 导入 → 选择.ris文件。