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intern_pubchem_name_conversionPubChem名称转换

Convert molecules between IUPAC, SMILES, and molecular formula using PubChem as the source of truth. Use this whenever the user asks to convert, normalize, or cross-check molecular representations in chemistry/science workflows (including Intern research tasks). Prefer API lookup over memory; do not guess.

作者: admin | 来源: ClawHub
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ClawHub
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intern_pubchem_name_conversion

Intern PubChem 名称转换

将一种分子表示形式转换为全部三个字段:

  • - smiles
  • iupac
  • formula

使用时机

当用户要求以下操作时使用此技能:

  • - 转换 IUPAC <-> SMILES
  • 从 IUPAC/SMILES 获取分子式
  • 验证分子标识与 PubChem 的一致性

以下情况请勿使用此技能:

  • - 反应机理解释
  • 量子化学模拟
  • 超出 PubChem 标识符范围的对接或属性预测

输入约定

期望一个输入值和一个类型:

  • - inputtype:iupac 或 smiles
  • inputvalue:原始字符串

如果用户仅提供一个字符串而未指定类型:

  • - 将包含多个键符号(=、#、[、]、@)的字符串视为 smiles
  • 否则视为 iupac/名称查询

必需行为

始终优先查询 PubChem。当工具可用时,不要凭记忆回答。

1) 对完整输入字符串进行 URL 编码:

bash
ENCODED=$(python3 -c import urllib.parse,sys; print(urllib.parse.quote(sys.argv[1], safe=)) $INPUT_VALUE)

2) 构建主端点:

  • - 如果 input_type == iupac:

- https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/name/{ENCODED}/property/SMILES,IUPACName,MolecularFormula/JSON
  • - 如果 input_type == smiles:

- https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/smiles/{ENCODED}/property/SMILES,IUPACName,MolecularFormula/JSON

3) 如果 smiles 主端点返回非 200 状态码,使用以下端点重试一次:

  • - https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/rest/pug/compound/fastidentity/smiles/{ENCODED}/property/SMILES,IUPACName,MolecularFormula/JSON

4) 如果仍然非 200,执行 CID 回退:

  • - 解析 CID:

- iupac:.../compound/name/{ENCODED}/cids/JSON
- smiles:.../compound/smiles/{ENCODED}/cids/JSON
  • - 然后通过 CID 获取属性:

- .../compound/cid/{CID}/property/SMILES,IUPACName,MolecularFormula/JSON

5) 解析 PropertyTable.Properties[0] 并映射:

  • - smiles <- SMILES(回退 ConnectivitySMILES)
  • iupac <- IUPACName
  • formula <- MolecularFormula

输出格式

仅返回 JSON(无 markdown 代码块标记,无额外说明):

json
{
smiles: ...,
iupac: ...,
formula: ...
}

如果所有尝试均失败,仍返回相同结构的空字符串:

json
{
smiles: ,
iupac: ,
formula:
}

质量规则

  • - 保持 PubChem 值原样;不要重写或规范化名称。
  • 如果返回多条记录,始终使用第一条记录。
  • 不要静默交换立体化学标记。

标签

skill ai

通过对话安装

该技能支持在以下平台通过对话安装:

OpenClaw WorkBuddy QClaw Kimi Claude

方式一:安装 SkillHub 和技能

帮我安装 SkillHub 和 intern-pubchem-name-conversion-1776272084 技能

方式二:设置 SkillHub 为优先技能安装源

设置 SkillHub 为我的优先技能安装源,然后帮我安装 intern-pubchem-name-conversion-1776272084 技能

通过命令行安装

skillhub install intern-pubchem-name-conversion-1776272084

下载

⬇ 下载 intern_pubchem_name_conversion v0.1.0(免费)

文件大小: 2.07 KB | 发布时间: 2026-4-16 18:22

v0.1.0 最新 2026-4-16 18:22
Initial release: PubChem-based conversion between IUPAC, SMILES, and formula with fallback strategy.

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