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OPI-Llama-3.1-8B-Instruct

BAAI/OPI-Llama-3.1-8B-Instruct

发布机构北京智源人工智能研究院(BAAI)已核实

已核对来源国内镜像可用

OPI-Llama-3.1-8B-Instruct 是一个专门针对蛋白质相关任务进行微调的大语言模型,基于 Meta-Llama-3.1-8B-Instruct 训练。该模型用于处理蛋白质科学领域的各种任务,包括序列理解、功能注释预测和知识挖掘等。 输入:自然语言形式的蛋白质序列、基因符号或基因名称相关查询 输出:基于蛋白质科学知识的预测结果,如 EC 编号、折叠类型、功能关键词、GO 术语、功能描述、组织位置或癌症预测等

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# OPI-Llama-3.1-8B-Instruct 模型卡片

模型用途

OPI-Llama-3.1-8B-Instruct 是一个专门针对蛋白质相关任务进行微调的大语言模型,基于 Meta-Llama-3.1-8B-Instruct 训练。该模型用于处理蛋白质科学领域的各种任务,包括序列理解、功能注释预测和知识挖掘等。

## 主要能力

该模型在以下九类任务上进行评估:

  • *序列理解任务**
  • EC 编号预测
  • 折叠类型预测
  • *亚细胞定位预测**
  • 蛋白质亚细胞定位预测
  • *注释预测**
  • 功能关键词预测
  • 基因本体(GO)术语预测
  • 功能描述预测
  • *知识挖掘**
  • 从基因符号预测组织位置
  • 从基因符号预测癌症
  • 从基因名称预测癌症

## 输入输出

输入:自然语言形式的蛋白质序列、基因符号或基因名称相关查询

输出:基于蛋白质科学知识的预测结果,如 EC 编号、折叠类型、功能关键词、GO 术语、功能描述、组织位置或癌症预测等

运行要求

基础模型:Meta-Llama-3.1-8B-Instruct

训练数据:OPI 完整训练集(1.61M 条训练数据)

基本用法

该模型基于完整的 OPI 训练集进行微调。如需使用或复现,需访问项目 GitHub 仓库获取训练和测试的详细说明。

## 评估结果

模型在各项测试任务上的性能表现如下:

  • *EC 编号预测**
  • split100 测试集:精确率 0.3724,召回率 0.3374,F1 值 0.3468
  • price 测试集:精确率 0.0738,召回率 0.0738,F1 值 0.0738
  • *折叠类型预测**
  • Fold Holdout:准确率 0.1045
  • Superfamily Holdout:准确率 0.1507
  • Family Holdout:准确率 0.6145
  • *亚细胞定位预测**
  • 准确率 0.4214
  • *功能关键词预测**
  • CASPSimilarSeq:精确率 0.4202,召回率 0.5057,F1 值 0.4385
  • IDFilterSeq:精确率 0.6762,召回率 0.6905,F1 值 0.6650
  • UniProtSeq:精确率 0.7606,召回率 0.7489,F1 值 0.7374
  • *GO 术语预测**
  • CASPSimilarSeq:精确率 0.1113,召回率 0.0936,F1 值 0.099
  • IDFilterSeq:精确率 0.6686,召回率 0.6287,F1 值 0.6304
  • UniProtSeq:精确率 0.7150,召回率 0.6897,F1 值 0.6849
  • *功能描述预测**
  • CASPSimilarSeq:Rouge-L 0.7524
  • IDFilterSeq:Rouge-L 0.4786
  • UniProtSeq:Rouge-L 0.5144
  • *组织位置预测**
  • 从基因符号预测:精确率 0.4002,召回率 0.9356,F1 值 0.5466
  • *癌症预测**
  • 从基因符号预测:精确率 0.2890,召回率 0.2701,F1 值 0.2664
  • 从基因名称预测:精确率 0.2786,召回率 0.2707,F1 值 0.2659

许可证

模型基于 Meta-Llama-3.1-8B-Instruct,需遵守其原始许可证条款。具体许可证信息请参阅 Meta 官方发布页面。

优先采用原作者提供的中文模型卡片;仅有英文说明时由闲社AI翻译整理。重要参数、许可证和商用范围请以原文为准。

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