Model details
模型介绍 中文整理 # Dayhoff 模型卡片
模型概述 Dayhoff是一个蛋白质序列数据和生成式语言模型的集合体，整合了33.4亿个蛋白质序列，涵盖17亿个宏基因组和自然蛋白质序列簇（GigaRef）、4600万个结构衍生合成序列（BackboneRef）以及1600万个多重序列比对（OpenProteinSet）。该模型可零样本预测突变对适应度的影响，通过进化或结构背景进行结构模体支架设计，并在指定家族内引导生成新蛋白质。
## 主要能力
无条件设计蛋白质序列 零样本预测突变效应（基于ProteinGym基准） 为结构模体在序列空间中设计支架（基于RFDiffusion和MotifBench） 同源物条件化生成 ## 输入输出
*输入格式**：单个蛋白质序列或展开的多重序列比对（MSA） 模型支持N→C和C→N双向自回归生成，具备顺序无关的填充能力。
运行要求 170M参数模型需8块NVIDIA A100或H100 GPU
3B参数模型需176块NVIDIA H100 GPU（使用混合分片模式的完全分片数据并行）
PyTorch 2.7.1
CUDA 12.8及以上
mamba-ssm、causal-conv1d、flash-attn
建议使用uv创建清洁环境进行安装。
基本用法 最简单的方式是通过HuggingFace接口使用模型。详细使用方法请参阅模型仓库中的README文档。
限制 仅限生成蛋白质序列或同源蛋白质序列 不可用于自然语言或其他生物序列（如DNA序列） 不保证所有生成的序列都真实可信 难以生成与任何自然序列缺乏序列同源性的高质量序列 License MIT
## 开发者
Kevin K. Yang、Sarah Alamdari、Alex J. Lee、Kaeli Kaymak-Loveless、Samir Char、Garyk Brixi、Carles Domingo-Enrich、Chentong Wang、Suyue Lyu、Nicolo Fusi、Neil Tenenholtz、Ava P. Amini
优先采用原作者提供的中文模型卡片；仅有英文说明时由闲社AI翻译整理。重要参数、许可证和商用范围请以原文为准。
你将获得什么 完整仓库方式包含该固定版本中的权重、配置、分词器及说明文件；指定版本方式只下载所选文件或整组分片。多模态模型的投影文件、配置等依赖，请按作者说明配齐。
完整仓库可能包含多个权重格式，因此需要的磁盘空间可能大于单一格式的模型大小。下载文件不等于完成模型部署。
使用前须知 运行环境 运行模型需要的设备、工具与依赖，以原作者说明为准。
授权范围 是否允许商用、修改和分发，请查看模型许可证。
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Dayhoff-170M-GRS-SS-98000 model download Download the full repository or choose a version or file.
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Full repository · All files Selected version / file Need just one GGUF precision? Load the file manifest and choose a version. Direct file links do not require Python; the command below can download multiple shards together.
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Choose your operating system Windows · PowerShell Linux / macOS · Terminal For command-line downloads, follow these steps to get the full repository or selected files. Direct file links do not need these steps.
1 Open a terminal window Create and open a folder for the model. In the folder's address bar, enter powershell and press Enter.
If Python is not installed, get it from the official Python website . In the terminal, enter python --version; continue when a version number appears.
2 First time? Install the download tool Copy this command, paste it into the terminal, press Enter and wait for installation to finish.
python -m pip install --upgrade huggingface_hubCopy install command Already installed? Continue to step 3.
3 Run the download command Select the button below, paste into the same terminal and press Enter. The tool downloads all files included in the current command.
Copy full download command Copying does not start a download. Paste and run the command on your device.
Where are the downloaded files? Open the folder you chose. Look for the models folder. When progress stops and the terminal returns to its prompt without errors, check that all files are present. 'Copied' does not mean 'downloaded'.
No response or an error? python not found: Install Python and reopen the terminal. On Windows, follow the installer's instructions to enable command-line access.
hf not found: Confirm that step 2 succeeded, then reopen the terminal. If needed, add Python's Scripts folder to your user PATH. Do not repeatedly download scripts.
Network interrupted: Stay in the same folder and run the same command again. The tool checks existing files.
Permission or disk error: Choose a writable folder with enough free space. Do not disable system security protection.
View the full download command 请开启浏览器脚本，或使用默认 Windows 教程并展开命令手动复制执行。
